1898 年（明治 31 年） 7 月 1 日：設嘉義國語傳習所鹽水港分教場，場址於現鹽水郵局。同年 10 月 1 日，創立鹽水港公學校。
1902 年（明治 35 年） 4 月 1 日：設查某營（今柳營區）分班。
1904 年（明治 37 年） 3 月 31 日：第一屆畢業典禮。
1905 年（明治 38 年） 9 月：新建校舍落成。
1908 年（明治 41 年）：查某營分班獨立設校為查某營公學校。
1915 年（大正 4 年） 3 月 25 日：設立義竹圍（今義竹鄉）分校。
1919 年（大正 8 年） 3 月 27 日：設立番仔厝分班；同年年 3 月 28 日義竹圍分校獨立為義竹圍公學校。
1921 年（大正 10 年） 4 月 1 日：增設高等科。同年 5 月 24 日改稱鹽水公學校。
1922 年（大正 11 年） 3 月 31 日：番仔厝分班獨立為番仔厝公學校。
1931 年（昭和 6 年） 4 月 1 日：附設幼稚園。
1941 年（昭和 16 年） 4 月 1 日：改稱鹽水東國民學校[1]。
1944 年（昭和 19 年） 4 月 1 日：分設月津分班。
1946 年 2 月 1 日：校名改為鹽水鎮第一國民學校。
1947 年 2 月 1 日：改稱鹽水國民學校，廢除高等科。
1947 年 2 月 13 日：月津分班獨立為月津國民學校。
1948 年：校務組織分校長、教導、兒童部、民教部班級數 20 班。
1953 年：校務組織分校長、教導下設教務、訓導、總務、研究四部，班級 24 班。
1950 年 8 月 1 日：分設汫水分校。
1964 年 10 月 31 日：成立幼童軍團二團並組訓鼓隊。
1967 年 8 月 1 日：汫水分校獨立為汫水國民學校。
1967 年 10 月 25 日慶祝創立 70 週年旅日校友王玉順先生捐建玉順館，落成典禮並舉行運動大會。
1968 年 8 月 1 日：改稱鹽水國民小學，實施九年國民義務教育畢業生免試直升國民中學，並實施修正國民小學暫行課程標準。
1974 年 8 月 1 日：改制校務組織校長下設教務、訓導、總務三處、下設課務、註冊、生活輔導、體衛等四組。
1974 年 9 月：辦理兒童齲齒防治中心。
1975 年 1 月 15 日：危險教室重建六間竣工。
1976 年：危險教室拆除重建五間竣工。
1977 年 5 月 15 日：發展與改進國民教育設備計畫改建四間教室，新建四間教室，並加強照明設備逐年更新課桌椅。
1977 年 8 月：實施國民小學新課程標準。
1982 年 4 月 3 日：操場填土司令台興建竣工。
1983 年 8 月 1 日：設置資賦優異班啟智班推展特殊教育。
1983 年 10 月 21 日：中正堂兼體育館破土。
1984 年 6 月：六年教育改進計畫，改建危險教室 2 間，增班教室 1 間竣工。
1984 年 8 月 20 日：趙東林校長因籌建中正堂兼體育館及興建辦公室操勞過度，積勞成疾因而病逝。
1985 年 3 月 15 日：六年國教計畫將危險教室改建 2 間、輔導室 1 間竣工啟用。
1985 年 5 月：自然增班教室二間竣工。
1985 年 8 月 1 日：改建樓梯間興建中堂開工。
1985 年 8 月 11 日：興建中正堂兼體育館落成典禮。
1985 年 10 月：興建北門路後校門。
1986 年 9 月 30 日：國教六年計畫增建教室二間。
1987 年 2 月：自然增班教室一間開工。
1987 年 4 月 3 日：舉辦創校九十週年校慶運動大會暨成績展覽。
1987 年 6 月：美勞教室啟用。
1989 年 2 月：整修朝琴路前校門。
1989 年 5 月：視聽教室完工。
1989 年 9 月 13 日：莎拉颱風侵襲造成鹽水鎮重大水災，校內淹水淺處達一公尺以上損失慘重。
1991 年 4 月 28 日：改建運動場完工並舉行社區運動會。
1991 年 10 月：興建 10 間教室竣工。
1992 年 3 月 13 日：開辦營養午餐。
1992 年 5 月：音樂教室竣工。
1992 年 8 月：本校女子網球隊獲全國冠軍，並至日本比賽榮獲冠軍，為國爭光。
1995 年 9 月：電腦教室成立。
1996 年 12 月：興建綜合球場。
1997 年 5 月 10－11 日：舉辦創校百週年校慶暨五育並重雕像落成。
2000 年 3 月 22 日：成立資源班並增購設備。
2000 年 10 月 5 日：採購午餐廚房設備。
2001 年 2 月 15 日：完成網球場修復工程。
2001 年 7 月 16 日：完成水溝加蓋及校園美化修繕工程。
2001 年 11 月 28 日：改善教學環境工程。
2001 年 12 月 28 日：運動場、網球場及周邊設備復建工程。
2002 年 8 月 1 日：汫水國小改制為鹽水國小汫水分校。
2003 年 1 月 2 日： 331 大地震復建教室樑柱牆壁、圍牆工程。
2003 年 2 月 12 日：更換活動中心窗簾、舞檯布幕。
2003 年 10 月 9 日：老舊教室防水防漏整建工程。
2003 年 11 月 5 日： 92 會計年度加強特教資源中心功能設備。
2004 年 7 月 23 日：活動中心電力增設工程。
2004 年 12 月 14 日：改善無障礙校園環境工程。
2004 年 12 月 23 日：中正堂修繕及學生木製櫥櫃建置。
2005 年 8 月 17 日：本校午餐公辦民營勞務採購。
2007 年 8 月：汫水分校廢校。
2008 年 3 月：神社修復。
2009 年 5 月：操場跑道興建完成。
2010 年 10 月：街角綠地文武步道整修工程。
2010 年 12 月：新建校舍奎璧樓落成啟用。
2011 年 6 月：新建圖書館奎璧書苑暨英語情境教室落成啟用。
2011 年 6 月：畢業生聯誼會捐贈重建鐘樓。
2013 年 10 月：幼兒園改善教學環境設備。
2013 年 10 月：獨立廁所整修工程。
2020 年 5 月：前瞻計畫補助校園無線網路，設置無線基地台二十二台。
2020 年 8 月 1 日：王惠足校長接任鹽水國小校長一職。