1898年(明治31年)7月1日:設嘉義國語傳習所鹽水港分教場,場址於現鹽水郵局。同年10月1日,創立鹽水港公學校。
1902年(明治35年)4月1日:設查某營(今柳營區)分班。
1904年(明治37年)3月31日:第一屆畢業典禮。
1905年(明治38年)9月:新建校舍落成。
1908年(明治41年):查某營分班獨立設校為查某營公學校。
1915年(大正4年)3月25日:設立義竹圍(今義竹鄉)分校。
1919年(大正8年)3月27日:設立番仔厝分班;同年年3月28日義竹圍分校獨立為義竹圍公學校。
1921年(大正10年)4月1日:增設高等科。同年5月24日改稱鹽水公學校。
1922年(大正11年)3月31日:番仔厝分班獨立為番仔厝公學校。
1931年(昭和6年)4月1日:附設幼稚園。
1941年(昭和16年)4月1日:改稱鹽水東國民學校[1]。
1944年(昭和19年)4月1日:分設月津分班。
1946年2月1日:校名改為鹽水鎮第一國民學校。
1947年2月1日:改稱鹽水國民學校,廢除高等科。
1947年2月13日:月津分班獨立為月津國民學校。
1948年:校務組織分校長、教導、兒童部、民教部班級數20班。
1953年:校務組織分校長、教導下設教務、訓導、總務、研究四部,班級24班。
1950年8月1日:分設汫水分校。
1964年10月31日:成立幼童軍團二團並組訓鼓隊。
1967年8月1日:汫水分校獨立為汫水國民學校。
1967年10月25日慶祝創立70週年旅日校友王玉順先生捐建玉順館,落成典禮並舉行運動大會。
1968年8月1日:改稱鹽水國民小學,實施九年國民義務教育畢業生免試直升國民中學,並實施修正國民小學暫行課程標準。
1974年8月1日:改制校務組織校長下設教務、訓導、總務三處、下設課務、註冊、生活輔導、體衛等四組。
1974年9月:辦理兒童齲齒防治中心。
1975年1月15日:危險教室重建六間竣工。
1976年:危險教室拆除重建五間竣工。
1977年5月15日:發展與改進國民教育設備計畫改建四間教室,新建四間教室,並加強照明設備逐年更新課桌椅。
1977年8月:實施國民小學新課程標準。
1982年4月3日:操場填土司令台興建竣工。
1983年8月1日:設置資賦優異班啟智班推展特殊教育。
1983年10月21日:中正堂兼體育館破土。
1984年6月:六年教育改進計畫,改建危險教室2間,增班教室1間竣工。
1984年8月20日:趙東林校長因籌建中正堂兼體育館及興建辦公室操勞過度,積勞成疾因而病逝。
1985年3月15日:六年國教計畫將危險教室改建2間、輔導室1間竣工啟用。
1985年5月:自然增班教室二間竣工。
1985年8月1日:改建樓梯間興建中堂開工。
1985年8月11日:興建中正堂兼體育館落成典禮。
1985年10月:興建北門路後校門。
1986年9月30日:國教六年計畫增建教室二間。
1987年2月:自然增班教室一間開工。
1987年4月3日:舉辦創校九十週年校慶運動大會暨成績展覽。
1987年6月:美勞教室啟用。
1989年2月:整修朝琴路前校門。
1989年5月:視聽教室完工。
1989年9月13日:莎拉颱風侵襲造成鹽水鎮重大水災,校內淹水淺處達一公尺以上損失慘重。
1991年4月28日:改建運動場完工並舉行社區運動會。
1991年10月:興建10間教室竣工。
1992年3月13日:開辦營養午餐。
1992年5月:音樂教室竣工。
1992年8月:本校女子網球隊獲全國冠軍,並至日本比賽榮獲冠軍,為國爭光。
1995年9月:電腦教室成立。
1996年12月:興建綜合球場。
1997年5月10-11日:舉辦創校百週年校慶暨五育並重雕像落成。
2000年3月22日:成立資源班並增購設備。
2000年10月5日:採購午餐廚房設備。
2001年2月15日:完成網球場修復工程。
2001年7月16日:完成水溝加蓋及校園美化修繕工程。
2001年11月28日:改善教學環境工程。
2001年12月28日:運動場、網球場及周邊設備復建工程。
2002年8月1日:汫水國小改制為鹽水國小汫水分校。
2003年1月2日:331大地震復建教室樑柱牆壁、圍牆工程。
2003年2月12日:更換活動中心窗簾、舞檯布幕。
2003年10月9日:老舊教室防水防漏整建工程。
2003年11月5日:92會計年度加強特教資源中心功能設備。
2004年7月23日:活動中心電力增設工程。
2004年12月14日:改善無障礙校園環境工程。
2004年12月23日:中正堂修繕及學生木製櫥櫃建置。
2005年8月17日:本校午餐公辦民營勞務採購。
2007年8月:汫水分校廢校。
2008年3月:神社修復。
2009年5月:操場跑道興建完成。
2010年10月:街角綠地文武步道整修工程。
2010年12月:新建校舍奎璧樓落成啟用。
2011年6月:新建圖書館奎璧書苑暨英語情境教室落成啟用。
2011年6月:畢業生聯誼會捐贈重建鐘樓。
2013年10月:幼兒園改善教學環境設備。
2013年10月:獨立廁所整修工程。
2020年5月:前瞻計畫補助校園無線網路,設置無線基地台二十二台。
2020年8月1日:王惠足校長接任鹽水國小校長一職。