1898 年(明治 31 年) 7 月 1 日:設嘉義國語傳習所鹽水港分教場,場址於現鹽水郵局。同年 10 月 1 日,創立鹽水港公學校。
1902 年(明治 35 年) 4 月 1 日:設查某營(今柳營區)分班。
1904 年(明治 37 年) 3 月 31 日:第一屆畢業典禮。
1905 年(明治 38 年) 9 月:新建校舍落成。
1908 年(明治 41 年):查某營分班獨立設校為查某營公學校。
1915 年(大正 4 年) 3 月 25 日:設立義竹圍(今義竹鄉)分校。
1919 年(大正 8 年) 3 月 27 日:設立番仔厝分班;同年年 3 月 28 日義竹圍分校獨立為義竹圍公學校。
1921 年(大正 10 年) 4 月 1 日:增設高等科。同年 5 月 24 日改稱鹽水公學校。
1922 年(大正 11 年) 3 月 31 日:番仔厝分班獨立為番仔厝公學校。
1931 年(昭和 6 年) 4 月 1 日:附設幼稚園。
1941 年(昭和 16 年) 4 月 1 日:改稱鹽水東國民學校[1]。
1944 年(昭和 19 年) 4 月 1 日:分設月津分班。
1946 年 2 月 1 日:校名改為鹽水鎮第一國民學校。
1947 年 2 月 1 日:改稱鹽水國民學校,廢除高等科。
1947 年 2 月 13 日:月津分班獨立為月津國民學校。
1948 年:校務組織分校長、教導、兒童部、民教部班級數 20 班。
1953 年:校務組織分校長、教導下設教務、訓導、總務、研究四部,班級 24 班。
1950 年 8 月 1 日:分設汫水分校。
1964 年 10 月 31 日:成立幼童軍團二團並組訓鼓隊。
1967 年 8 月 1 日:汫水分校獨立為汫水國民學校。
1967 年 10 月 25 日慶祝創立 70 週年旅日校友王玉順先生捐建玉順館,落成典禮並舉行運動大會。
1968 年 8 月 1 日:改稱鹽水國民小學,實施九年國民義務教育畢業生免試直升國民中學,並實施修正國民小學暫行課程標準。
1974 年 8 月 1 日:改制校務組織校長下設教務、訓導、總務三處、下設課務、註冊、生活輔導、體衛等四組。
1974 年 9 月:辦理兒童齲齒防治中心。
1975 年 1 月 15 日:危險教室重建六間竣工。
1976 年:危險教室拆除重建五間竣工。
1977 年 5 月 15 日:發展與改進國民教育設備計畫改建四間教室,新建四間教室,並加強照明設備逐年更新課桌椅。
1977 年 8 月:實施國民小學新課程標準。
1982 年 4 月 3 日:操場填土司令台興建竣工。
1983 年 8 月 1 日:設置資賦優異班啟智班推展特殊教育。
1983 年 10 月 21 日:中正堂兼體育館破土。
1984 年 6 月:六年教育改進計畫,改建危險教室 2 間,增班教室 1 間竣工。
1984 年 8 月 20 日:趙東林校長因籌建中正堂兼體育館及興建辦公室操勞過度,積勞成疾因而病逝。
1985 年 3 月 15 日:六年國教計畫將危險教室改建 2 間、輔導室 1 間竣工啟用。
1985 年 5 月:自然增班教室二間竣工。
1985 年 8 月 1 日:改建樓梯間興建中堂開工。
1985 年 8 月 11 日:興建中正堂兼體育館落成典禮。
1985 年 10 月:興建北門路後校門。
1986 年 9 月 30 日:國教六年計畫增建教室二間。
1987 年 2 月:自然增班教室一間開工。
1987 年 4 月 3 日:舉辦創校九十週年校慶運動大會暨成績展覽。
1987 年 6 月:美勞教室啟用。
1989 年 2 月:整修朝琴路前校門。
1989 年 5 月:視聽教室完工。
1989 年 9 月 13 日:莎拉颱風侵襲造成鹽水鎮重大水災,校內淹水淺處達一公尺以上損失慘重。
1991 年 4 月 28 日:改建運動場完工並舉行社區運動會。
1991 年 10 月:興建 10 間教室竣工。
1992 年 3 月 13 日:開辦營養午餐。
1992 年 5 月:音樂教室竣工。
1992 年 8 月:本校女子網球隊獲全國冠軍,並至日本比賽榮獲冠軍,為國爭光。
1995 年 9 月:電腦教室成立。
1996 年 12 月:興建綜合球場。
1997 年 5 月 10-11 日:舉辦創校百週年校慶暨五育並重雕像落成。
2000 年 3 月 22 日:成立資源班並增購設備。
2000 年 10 月 5 日:採購午餐廚房設備。
2001 年 2 月 15 日:完成網球場修復工程。
2001 年 7 月 16 日:完成水溝加蓋及校園美化修繕工程。
2001 年 11 月 28 日:改善教學環境工程。
2001 年 12 月 28 日:運動場、網球場及周邊設備復建工程。
2002 年 8 月 1 日:汫水國小改制為鹽水國小汫水分校。
2003 年 1 月 2 日: 331 大地震復建教室樑柱牆壁、圍牆工程。
2003 年 2 月 12 日:更換活動中心窗簾、舞檯布幕。
2003 年 10 月 9 日:老舊教室防水防漏整建工程。
2003 年 11 月 5 日: 92 會計年度加強特教資源中心功能設備。
2004 年 7 月 23 日:活動中心電力增設工程。
2004 年 12 月 14 日:改善無障礙校園環境工程。
2004 年 12 月 23 日:中正堂修繕及學生木製櫥櫃建置。
2005 年 8 月 17 日:本校午餐公辦民營勞務採購。
2006 年 8 月:汫水分校廢校。
2008 年 3 月:神社修復。
2009 年 5 月:操場跑道興建完成。
2010 年 10 月:街角綠地文武步道整修工程。
2010 年 12 月:新建校舍奎璧樓落成啟用。
2011 年 6 月:新建圖書館奎璧書苑暨英語情境教室落成啟用。
2011 年 6 月:畢業生聯誼會捐贈重建鐘樓。
2013 年 10 月:幼兒園改善教學環境設備。
2013 年 10 月:獨立廁所整修工程。
2020 年 5 月:前瞻計畫補助校園無線網路,設置無線基地台二十二台。
2020 年:中正堂舞台布幕及窗簾更新
2020 年:新建半戶外風雨球場完工
2020 年:門窗更新工程
2020 年:附設幼兒園兒童遊戲場修繕
2020 年:廚房鍋爐安全隔間工程
2021 年 6 月:中正堂更名為活動中心
2022 年 7 月:北門路門口整修工程完工
2022 年 11 月:新設國小兒童遊戲場完工
2023 年 3 月:幼兒園屋頂防水工程竣工
2023 年 4 月:操場跑道整建工程竣工